Dá para usar desconto manual junto com promoções?

Sim. A regra é "o manual vence, e as camadas continuam independentes":

• Desconto manual no item: essa linha deixa de receber promoções de item, pois seu desconto manual é tratado como a decisão final na hora. Ainda assim, o valor da linha conta para as metas de gasto.
• Desconto manual no carrinho: é aplicado depois que todas as promoções foram calculadas, então os dois convivem. Se você digitar um valor maior que o total restante, ele é limitado automaticamente, com um aviso.

Ao remover um desconto manual, a linha volta a ser elegível para promoções na próxima avaliação.